农产品结构与市场结构不相适应，导致农产品难卖问题经常性突出。由于缺乏强有力的沟通城市、面向国内外大市场的流通体系，千家万户的小生产与千变万化的大市场缺乏有效的联结手段，难以避免结构调整的盲目性。产品结构不合理，质量水平不高，不适应市场对农产品需求多样化、优质化和精细化的需求，致使农业发展长期缺乏有效的市场拉动力。
3.由于庞大的乡村管理构架与薄弱的乡村经济不相适应，导致乡村负债问题十分突出，不仅使正常的经济周转困难，还使乡村的信用体系受到严重破坏。由于长期缺乏文化、教育等方面的足够投入，农民素质差、生活单调，缺乏必要的文化消费等现象十分突出。在原有的严密组织被破除后，乡村社区建设成为整个中国社区建设最为薄弱的环节，由于缺乏互帮互助机制，缺乏行业协调机制，从而农民成为最无组织性的群体。由于基层组织和乡级政府职能上的错位，乡村规划落后，或基本上没有规划，执行规划不得力的问题十分普遍，导致乡村建设混乱，村容、村貌不堪入目。乡村环境的脏乱差已成为中国最大的环境问题之一。
被列为新农村建设试点村的浙江省永康市荆山夏村，2007年推出了“家家都有别墅住”的村民别墅工程，并声称要做“全国一流”的样板村，结果却适得其反，111幢村民别墅群不仅成了烂尾楼，而且还负债8000多万元。据村民们反映说，当时村里推出村民别墅工程，不仅没有召开村民大会，而且还强迫村民拆迁旧屋和强行克扣全村每人1.2万元的征地补偿款。最后也只是象征性地给村民发了张征求意见表，虽然多数村民在意见表上反对建别墅，但是，村民们填写的反对意见最后都被涂改了。其中一位村民愤怒地说：“这是强奸民意，是违法行为!”
4.1978年以来打破“一大二公”形成的对农民的集中管理，通过联产承包把农民从生产力的束缚中解放出来，还劳动者生产选择的自主权和产品的所有权，使生产的成果与自身的利益紧密地联系起来。这种联产联利，使农民的生产积极性一下子焕发出来，成为推动农业高速增长的强大动力。1978～1985年，农业净产值年平均增长6.4%，农民纯收入年均增长16.9%，是农业超常规增长时期。
1985年至20世纪90年代初，在主要农产品产量相对稳定的情况下，农民收入的增长主要靠结构调整。农业内部经济作物、养殖业比重扩大，乡镇企业异军突起，成为农民收入的主要增长点。但这一时期由于农产品价格走低、各种税费增多，农民收入增长受到抑制，城乡差距进一步扩大。
20世纪90年代初至今，由于城市化速度加快，城市基础设施突飞猛进地发展，中国工业化进入新的阶段，沿海地区向内地转移产业的步伐加快，沿海与内地工业化、城市化的发展，需要大量劳动力，而农村正是这种廉价劳动力的主要来源。尽管农民务工收入已占到农民收入的相当比重，2002年江西全省农民人均在外务工得到的纯收入为658元，占全省农民人均纯收入的28.2%，但农民的身份未变，农民外出务工是劳动地点的外延而不是真正的身份置换，因而也不可能与城市真正融合在一起。在这一过程中，城乡差距进一步扩大。