马克思主义哲学、外国哲学、政治经济学、世界经济、金融学、产业经济学、政治学理论、国际关系、汉语言文字学、中国古代文学、传播学、历史地理学、基础数学、应用数学、运筹学与控制论、理论物理、凝聚态物理、光学、物理化学、高分子化学与物理、生理学、神经生物学、遗传学、生态学、电路与系统、微电子学与固体电子学、人体解剖与组织胚胎学、病原生物学、病理学与病理生理学、内科学（心血管病，传染病，肾病）、儿科学神经病学、影像医学与核医学、外科学（普外，泌尿外，神外，骨外）、眼科学、耳鼻咽喉科学、肿瘤学、中西医结合基础、中西医结合临床、社会医学与卫生事业管理
上海交大国家重点学科（(按二级学科统计20个，按三级学科统计22个)
凝聚态物理、工程力学、机械制造及其自动化、机械设计及理论、材料学、材料加工工程、动力机械及工程、制冷及低温工程、电磁场与微波技术、通信与信息系统、控制理论与控制工程、模式识别与智能系统、计算机软件与理论、船舶与海洋结构物设计制造、生物医学工程、管理科学与工程、内科学（血液病，消化系病，内分泌与代谢病）、儿科学、外科学（整形）、口腔临床医学
同济大学国家重点学科(10个)
海洋地质、工程力学、材料学、城市规划与设计、岩土工程、结构工程、桥梁与隧道工程、道路与铁道工程、交通运输规划与管理、环境工程
华东师范大学国家重点学科（6个）
教育学原理、课程与教学论、教育史、基础心理学、自然地理学、生态学
东华大学国家重点学科（4个）
材料学、纺织工程、纺织化学与染整工程、服装设计与工程
上海财经大学国家重点学科(３个)
经济思想史、财政学、会计学
上海大学国家重点学科（2个）
机械电子工程、钢铁冶金
第二军医大学国家重点学科（按二级学科统计9个，按三级学科统计12个）
生理学、遗传学、免疫学、航空航天与航海医学、内科学（消化系病）、影像医学与核医学、外科学（普外、胸心外、骨外、烧伤）、中西医结合、临床药理学
华东理工大学国家重点学科（３个）
化学工程、生物化学、应用化学
上海外国语大学国家重点学科（2个）
英语、俄语