莆田学院深化后勤改革，以适应学校快速发展的需要，促使后勤管理主动服务于教学科研，提高后勤干部职工的积极性，增强服务意识。
自2003年，该校实行后勤社会化改革以来，后勤部门和人员为学校的发展作出了应有的贡献。为了提高学校后勤队伍为教学、科研和师生员工的服务水平和服务质量，坚持社会效益和经济效益并行以社会效益为先的原则，从7月份起，学校将对后勤管理实施一系列改革：即合并总务处和后勤服务中心，成立后勤管理处；管理处下设五个科级机构，分别为后勤管理处办公室、财务结算中心、餐饮服务中心、物业服务中心、水电服务中心；办公室和财务结算中心实行事业管理，其它三个中心实行事业单位企业化管理模式；学校对后勤管理处改变拨款方式，实行经费包干；管理处内部对下属各中心实行目标管理；各中心实行合理定岗，竞聘上岗，中心主任两年签订一次劳动合同，职工一年一次；学校对各中心实行会计委派制度，学校财务处统一管理各实体的财务收支活动，建立成本核算体系和成本核算制度，学校监审处实行年度审计制度，并制定一整套行之有效的科学管理制度，扎实做好后勤保障工作。