新疆维吾尔自治区面积166.04万平方公里，2012年人口2233万人，人均GDP33796元。截止2009年，共评价11所普通本科大学，其中211工程大学2所。教师9988人，在校博士生552人，硕士生10576人，普通本科生119614人，留学[微博]生2051人。
| 分省排名 | 全国排名 | 校名 | 效率等级 | 效率得分 | 师资总数 | 教学科研总得分 | 备注一 | 备注二 |
| 1 | 190 | 新疆大学 | B | 0.8996 | 1675 | 12.20 | 211工程大学 | |
| 2 | 241 | 石河子大学 | C+ | 0.6845 | 1578 | 8.74 | 211工程大学 | |
| 3 | 312 | 新疆农业大学 | C | 0.5689 | 875 | 4.03 | ||
| 4 | 343 | 新疆艺术学院 | C | 0.5244 | 242 | 1.03 | ||
| 5 | 345 | 新疆医科大学 | C | 0.5217 | 1135 | 4.80 | ||
| 6 | 新疆师范大学 | D+ | ||||||
| 7 | 新疆财经大学 | D | ||||||
| 8 | 塔里木大学 | D | ||||||
| 9 | 伊犁师范学院 | E | ||||||
| 10 | 喀什师范学院 | E | ||||||
| 11 | 昌吉学院 | E |
注：2014中国大学各项指标等级评价标准
2014中国大学各项指标等级评价采用百分比法，用A、B、C、D、E共5等11级表示各大学的实力。各等级定义如下：
A等：前10%为A等；其中实力最强的前2%是A++级，介于2%～5%(含，以下同)之间的是A+级，5%~10%为A级。
B等：介于10%～30%之间为B等，占20%；其中 10%~20%为B+级，20%~30%为B级。
C等：介于30%～50%之间为C等，占20%；其中 30%~40%为C+级，40%~50%为C级。
D等：介于50%～70%之间为D等，占20%；其中50%~60%为D+级，60%~70%为D级。
E等：最后的30%为E等；其中70%～85%为E+级，85%~100%为E级。