南京工程高等职业学校始建于1956年，2002年由江苏省地质矿产厅划归江苏省教育厅管辖，次年，由普通中等职业学校升格为高等职业学校，同时增挂江苏联合职业技术学院南京工程分院，是南京地区唯一一所隶属于江苏省教育厅的公办五年制高等职业学校。
学校位于风景秀丽的钟山风景区，毗邻仙林大学城，拥有占地面积300亩，校舍近10万平方米，在校大专生5700余名，有教职员工300余名。学校设有地质工程系、建筑工程系、电子工程系、信息科学系和管理科学系五大系部共10个专业。
学校高度重视实训基地建设和校园基础建设。现已建成并投入使用的实验实训场达89980平方米，另有校外专业实训基地104个。学校设有国土资源职业技能鉴定所，是国家级重点职业学校,东南大学职教师资教育实习基地, 国家级建设行业技能型紧缺人才的培养培训基地。学校设有中国地质大学江苏教育站、东南大学远程教育中心等。
学校重视教师队伍建设和教育科研工作。现有副教授及以上职称的教师60名，省级专业带头人6名；在专业教师中，“双师型”教师占70%；青年教师中，研究生学历占35%。近三年来，学校承担各级各类课题研究20余项。通过课题引领课程改革，教师在研究中理论水平得到了升华，实践能力得到了提高，先后在省级以上刊物上发表论文300多篇，其中，发表在中文核心期刊20余篇；通过课题引领，重构了人才培养方案，突出了技能训练和能力的培养，学生的高级工取证率达到87%，参加市级以上技能大赛获奖20余次，我校电子系参加江苏省2008TI杯大学生模拟电路设计竞赛，与本科院校学生同台竞争，荣获二等奖。