九年级毕业生的考试科目为：语文、数学、外语（汉语）、物理、化学、历史、思想品德、体育与艺术，其中物理与化学两科合卷，思想品德与历史两科合卷。在思想品德与历史两科合卷中，加入民族团结教育内容（含新疆地方史），分值30分。2016年初中学业水平考试“民族团结教育(含新疆地方史)”部分的考试内容采用人民教育出版社出版的义务教育课程标准实验教科书《思想政治》（九年级全一册）、新疆教育出版社出版的义务教育课程标准地方教材《新疆·民族团结篇》(试用)(九年级全一册)和《中国新疆·发展篇》(试用)(九年级全一册)、新疆教育出版社出版的义务教育课程标准地方教材《新疆·地方历史篇》(试用)(八年级下册)和中国青年出版社出版的《可爱的兵团》中的内容。各考试科目的分值、内容比例等要求详见自治区制定的初中学考各学科考试说明。
考试与考查时间
（一）考试时间（北京时间）：
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日期 |
上午 |
下午 |
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6月20日 |
10：30-12：30语文 |
16：30-18：30理化 |
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6月21日 |
10：30-12：30数学 |
16：30-18：30政史
19: 00-19:30 艺术理论 |
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6月22日 |
10：30-12：30英（汉）语 |
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（二）体育与艺术类考试和实验操作考查及“综合素质”的考查由各县市教育局、州直各中学安排在5月15日前完成。