贵州省共有17所二本大学参与了2016贵州二本大学排名理科，其中排名第一的是贵州医科大学，排名第二的是遵义医学院，排名第三的是贵州财经大学。
以下是贵州二本大学排名理科2016具体榜单，根据2015年理科二本录取平均分排名，包含部分专业在二本招生的一本大学。
贵州二本大学排名理科2016
| 贵州二本大学排名 | 学校名称 | 录取批次 | 录取线差 | 省市分数线 | 录取平均分 |
| 1 | 贵州医科大学 | 本科二批 | 71 | 372(第二批) | 443 |
| 2 | 遵义医学院 | 本科二批 | 65 | 372(第二批) | 437 |
| 3 | 贵州财经大学 | 本科二批 | 47 | 372(第二批) | 419 |
| 4 | 贵州师范大学 | 本科二批 | 43 | 372(第二批) | 415 |
| 5 | 贵阳中医学院 | 本科二批 | 37 | 372(第二批) | 409 |
| 6 | 贵州民族大学 | 本科二批 | 35 | 372(第二批) | 407 |
| 7 | 贵州师范学院 | 本科二批 | 22 | 372(第二批) | 394 |
| 8 | 贵州理工学院 | 本科二批 | 22 | 372(第二批) | 394 |
| 9 | 贵阳学院 | 本科二批 | 21 | 372(第二批) | 393 |
| 10 | 遵义师范学院 | 本科二批 | 16 | 372(第二批) | 388 |
| 11 | 贵州商学院 | 本科二批 | 9 | 372(第二批) | 381 |
| 12 | 黔南民族师范学院 | 本科二批 | 6 | 372(第二批) | 378 |
| 13 | 六盘水师范学院 | 本科二批 | 6 | 372(第二批) | 378 |
| 14 | 贵州工程应用技术学院 | 本科二批 | 6 | 372(第二批) | 378 |
| 15 | 凯里学院 | 本科二批 | 5 | 372(第二批) | 377 |
| 16 | 安顺学院 | 本科二批 | 4 | 372(第二批) | 376 |
| 17 | 铜仁学院 | 本科二批 | 0 | 372(第二批) | 372 |